La misión de FUNDECOR parte del principio de que, la conservación y el desarrollo, deben coexistir en armonía y consiste en conservar y promover el uso sostenible de los recursos naturales del Área de Conservación de la Cordillera Volcánica Central (ACCVC), mediante el desarrollo y aplicación de mecanismos de mercado y educación ambiental, para crear y transferir conocimiento que mejore la política pública ambiental nacional e internacional.

La visión es: FUNDECOR genera conocimiento, para desarrollar soluciones que armonicen la producción y la conservación y los intereses públicos y privados, posicionándose como una ONG ambientalista líder, que contribuye a lograr la sostenibilidad nacional e internacional.